การนำโหมดแทรกไปใช้โดยใช้การทดลอง pseudo3D

การใช้ชุดการทดลอง NMR ในโหมดอินเทอร์ลีฟ ช่วยให้แน่ใจว่าการทดลองทั้งหมดดำเนินการภายใต้เงื่อนไขที่เหมือนกัน
ซอฟต์แวร์เดลต้ามีความโปร่งใสอย่างเต็มที่ในการดำเนินการใช้งานและเสนอตัวเลือกต่างๆ ให้ผู้ใช้เลือก พารามิเตอร์การเข้าซื้อกิจการ "interleave" เป็นวิธีแก้ปัญหาที่ง่ายและรวดเร็ว ในกรณีของการทดลองแบบ 2 มิติเป็นชุด เป็นไปได้ที่จะนำการแทรกระหว่างกันผ่านการทดลองหลอก 3 มิติ

แทรกแซงผ่านการทดลอง pseudo3D

การทดลอง 3D NMR ใดๆ โดยพื้นฐานแล้วคือชุดของการทดลอง 1 มิติ (t3, มิติโดยตรง) ที่ได้มาจากการเพิ่มตัวแปรสองตัว คือ t1 และ t2 (มิติทางอ้อม) ตัวแปรของมิติทางอ้อมที่กำหนดเป็น y กำลังเพิ่มขึ้นก่อน ดังนั้น ถ้า t1 ถูกกำหนดให้กับมิติ y และ t2 ถึง z มิติ t1 จะเพิ่มขึ้นก่อน t2 สมมติว่าในการทดสอบ 2 มิติด้วย t1 ในมิติทางอ้อม y t1 ถูกกำหนดใหม่ให้กับมิติ z และอาร์เรย์ของจุดสองจุดถูกกำหนดเป็นมิติ y สมมติว่าแต่ละจุดในสองจุดนี้เป็นตัวแทนของการทดสอบที่แตกต่างกัน ผลลัพธ์จะเป็นการทดลอง pseudo3D ซึ่งทำการทดลองทั้งสองแบบในโหมดอินเตอร์ลีฟ การแทรกสอดเกิดขึ้นที่ระดับของลูป t1 ดั้งเดิม (t2 สำหรับ pseudo3D) การทดลองทั้งสองจะเสร็จสมบูรณ์พร้อมกันและจะถูกเก็บไว้ในไฟล์ pseudo3D ไฟล์เดียว

ตัวอย่างการใช้งาน

ไฟล์ jxp สำหรับการทดสอบ IPAP (¹H-¹⁵N ประเภท HSQC) ได้รับการแก้ไขเพื่อให้ได้การทดลอง pseudo3D ด้วยมิติ y ที่กำหนดให้กับอาร์เรย์สองจุดที่แสดงถึงการทดสอบ IP และ AP เนื่องจากมิติ y จะเพิ่มขึ้นก่อนมิติ z (¹⁵N ) IP และ AP ของการทดลองทั้งสองจะถูกรวบรวมในโหมดอินเตอร์ลีฟ ที่แต่ละจุดบนแกน z (¹⁵N ) IP และ AP FID ถูกรวบรวมตามลำดับ ดังนั้น การแทรกสอดเกิดขึ้นที่ระดับของลูป t1 (t2 สำหรับ pseudo3D) การทดลองได้รับการทดสอบกับตัวอย่างของ u-¹⁵N ระบุว่า Ubiquitin ใน 10% D₂O.

รูปที่ 1: สำหรับแต่ละจุด Z (¹⁵การทดลอง N มิติ), IP (Y=1) และ AP (Y=2) ดำเนินการตามลำดับ กล่าวอีกนัยหนึ่ง interleave loop คือด้านนอกเพื่อสแกนลูปและ inner to ¹⁵เอ็น ลูป

รูปที่ 2: ได้รับข้อมูล pseudo3D ที่เปิดด้วยหน้าต่างโปรเซสเซอร์

รูปที่ 3: ระนาบ XZ ที่ Y=1 คือสเปกตรัม IP (ซ้าย) และระนาบ XZ ที่ Y=2 คือสเปกตรัม AP (ขวา)

รูปที่ 4: สามารถบันทึกระนาบทั้งสองที่สอดคล้องกับการทดลอง IP และ AP แยกกันได้ จากนั้นสามารถรวมไฟล์ทั้งสองเข้าด้วยกันเพื่อให้ได้ส่วนประกอบด้านท้ายหรือดาวน์ฟิลด์

รูปที่ 5: ผลลัพธ์ของการเพิ่มสเปกตรัม IP และ AP สังเกตเฉพาะองค์ประกอบดับเบิ้ลดาวน์ฟิลด์เท่านั้น

คอนโซล：JNM-ECZ400S+ROYALPROBE™